Im Rahmen eines streng geheimen Containment-Notfallprotokolls wurde „Operation Valkyrie“ als letzte Eskalationsstufe innerhalb der Foundation aktiviert. Ursprünglich als redundantes Krisensystem der Verwaltung entwickelt, sollte es im Falle eines vollständigen Sicherheitszusammenbruchs sämtliche kritischen Einrichtungen isolieren und die Kontrolle über anomale Zonen zurückgewinnen.